東吳大學教師授課計劃表

檔案產生時間：2026/6/8 上午 05:15:00
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一、課程基本資料 Course Information
科目名稱 Course Title：
(中文)生物資訊學
(英文)BIOINFORMATICS		 開課學期 Semester：114學年度第2學期
開課班級 Class：微生四
授課教師 Instructor：柯惠棉
科目代碼 Course Code：BMB42801 單全學期 Semester/Year：單 分組組別 Section：
人數限制 Class Size： 必選修別 Required/Elective：選 學分數 Credit(s)：3
星期節次 Day/Session： 一34E　 前次異動時間 Time Last Edited：115年05月04日15時35分
※ 因授課需求教室如安排於語練教室需加收語言實習費
課程與聯合國永續發展目標關聯性 Course match with UN SDGs (Sustainable Development Goals)
>SDG3 良好健康與社會福利 Good Health and Well-Being
>SDG4 優質教育 Quality Education
>SDG8 體面工作與經濟成長 Decent Work and Economic Growth
>SDG15 陸域生態 Life on Land
課程與社會力關聯性 Course match with Employment Soft Skills
微生物學系基本能力指標 Basic Ability Index
編號
Code		 指標名稱
Basic Ability Index		 本科目對應之指標
Correspondent Index		 達成該項基本能力之考評方式
Methods Of Evaluating This Ability
1具備基礎自然科學專業知識
To acquire the basic knowledage on natural science.		●》紙筆測驗
2具備微生物學專業知識
To acquire professional knowledge on microbiology.		●》紙筆測驗
3具備實驗執行能力
To possess the ability of experiemntal execution.		●》紙筆測驗
4具備明辨、構思、解決問題之能力
To possess the ability of discernment, idea and problems-solving.		●》紙筆測驗
5具備溝通、協調與團隊合作的能力
To possess the ability of communication, coordination and teamwork.		●》課堂討論與表現
》報告(含個人或小組、口頭或書面、專題、訪問、觀察等形式)
二、指定教科書及參考資料 Textbooks and Reference
(請修課同學遵守智慧財產權，不得非法影印)
●指定教科書 Required Texts

●參考書資料暨網路資源 Reference Books and Online Resources
Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins 4th
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
三、教學目標 Objectives
基因體研究的進步增進我們對基因功能、調控、以及其應用更加了解。本課程將介紹生物資訊發展歷程，生物資料庫，基因體、轉錄體、蛋白質體、代謝體等分析及應用。學生學習後將有對基因體的基礎了解，及其發展運用，並操作以及了解網路資源之使用。
Our knowledge to gene function, regulation and application is greatly improved by the advances of genomic research. This course introduces the development of bioinformatics, the concepts of genomics, transcriptomics, metabolomics, and basic analysis.
四、課程內容 Course Description
●整體敘述 Overall Description
本課程將先介紹生物資訊學以及網路資料庫，進而了解不同體學範疇及運用。
●分週敘述 Weekly Schedule
週次 Wk 日期 Date 課程內容 Content 備註 Note

1

 2/23 Introduction to bioinformatics  　

2

 3/2 From the early days to NGS
  　

3

 3/9 Linux (電腦上網)  　

4

 3/16 Genomics (電腦上網)  　

5

 3/23 Pairwise sequence similarity & blast (電腦上網)  　

6

 3/30 生成式AI 對學習以及研究的幫助: 以Transcriptional Regulation為例  　

7

 4/6 學術交流週  　

8

 4/13 Database (電腦上網)  　

9

 4/20 Mapping or R 　 

10

 4/27 GWAS  　

11

 5/4 Molecular evolution and phylogenetic analysis
  　

12

 5/11 Microbial community  　

13

 5/18 RNAseq
 　 

14

 5/25 Gene annotation + enrichment analysis 　 
五、考評及成績核算方式 Grading
本科目 ☑同意期末退修且不需面談輔導
配分項目 Items 次數 Times 配分比率 Percentage 配分標準說明 Grading Description
出席1210%請假方式依「東吳大學學生請假規則」規定使用請假系統 (請確認請假系統是否成功)。
隨堂考660%請假方式依「東吳大學學生請假規則」規定使用請假系統 (請確認請假系統是否成功)。
作業或小考因故未繳交，需依學校規定請假後補交不扣分。
若無故未到，補交或補考成績打6折
若無繳交作業或考試，視為0分
作業報告上傳330%請假方式依「東吳大學學生請假規則」規定使用請假系統 (請確認請假系統是否成功)。 作業或小考因故未繳交，需依學校規定請假後補交不扣分。 若無故未到，補交或補考成績打6折 若無繳交作業或考試，視為0分
配分比率加總 100%  
六、授課教師課業輔導時間和聯絡方式 Office Hours And Contact Info
●課業輔導時間 Office Hour
周一 14:00~15:00
●聯絡方式 Contact Info
研究室地點 Office：M212 EMAIL：hmke@scu.edu.tw
聯絡電話 Tel：(02) 28819471 轉 6859 其他 Others：
七、教學助理聯絡方式 TA’s Contact Info
教學助理姓名 Name 連絡電話 Tel EMAIL 其他 Others
八、建議先修課程 Suggested Prerequisite Course
九、課程其他要求 Other Requirements
十、學校數位學習平台及教師個人網址 University’s Web Portal And Teacher's Website
學校數位學習平台 University’s Digital Learning Platform：https://tronclass.scu.edu.tw
教師個人網址 Teacher's Website：
其他 Others：
十一、計畫表公布後異動說明 Changes Made After Posting Syllabus
"Mapping or R" 改為 "Introduction to Artificial Intelligence in Bioinformatics"